Standard HPC grant 2009 winners

121 projects for a total of 7,156,600 assigned hours have been approved for this grant. They are reported below sorted by the name of their principal investigator.

Name Organization Project title Scientific Area Hours
Isabella Abbate Laboratory of Virology National Institute for Infectious Diseases “L. Spallanzani” Investigation through molecular dynamics simulation of the sequence-dependent conformations sampled by the V3 gp120 loop. Medicine 80,000
Juan Acebron Center for Mathematics and its applications (CEMAT), Instituto Superior Tecnico Probabilistic domain decomposition for nonlinear partial differential equations Mathematics 80,000
Giuseppe Alesii Dipartimento di Matematica Pura e Applicata, Facolta’ di Scienze, Universita’ dell’Aquila Monte Carlo Methods for General Switching American Real Options Quantitative Finance 16,000
Paola Alippi CNR-ISM Ab initio design of a magnetic structural ferroelectric Condensed Matter Physics 60,000
Paola Alippi CNR-ISM Mott-insulating transition-metal monoxides from first principles calculations Condensed Matter Physics 50,000
Garry Angus University of Torino Fully resolved N-body simulations of dwarf galaxies in Modified Newtonian Dynamics Astrophysics 70,000
Vincenzo Armenio University of Trieste Improvement of a LES model for pollutant dispersion in urban environment Fluid Dynamics 80,000
Andrea Battistoni Dept. Biology University of Rome “Tor Vergata” Drug design for the inhibition of the bacterial high affinity Zn-uptake system using virtual screening molecular docking Medicine 80,000
Federico Becca CNR-INFM DEMOCRITOS and SISSA Unconventional quantum phases in correlated bosonic models on the lattice Condensed Matter Physics 80,000
Andrea Benazzo Università degli studi di Ferrara Simulazioni di variabilità genetica in popolazioni antiche e moderne Biology 50,000
Fabio Bernardini Dip. di Fisica, Universita di Cagliari First principles investigation of the pairing mechanism in Fe-based high-temperature superconductors Condensed Matter Physics 40,000
Stefano Berrone Politecnico di Torino, Dipartimento di Matematica Space-Time adaptivity for incompressible turbulent Navier-Stokes problems Mathematics 80,000
Sergio Betti CNR Numerical simulation of laser-driven particle acceleration at ultrahigh pulse intensities Plasma Physics 20,000
Luca Biferale University of Rome, “Tor Veragata” Lattice Boltzmann Models for multiphase flows Fluid Dynamics 80,000
Silvia Biocca Department of Neuroscience and Laboratory of Clinical Biochemistry, University of Rome “Tor Vergata” LOX-1 come target terapeutico nell’aterosclerosi e nell’infarto del miocardio Medicine 70,000
Olmes Bisi Università di Modena e Reggio Emilia Si/Ge nanowires: role of many body effects and doping NanoScience 80,000
Gianfranco Bocchinfuso Università di Tor Vergata Molecole in azione: simulazione della permeabilizzazione di membrane modello promossa da aggregati di peptidi antimicrobici. Chemistry 20,000
Aldo Bonfiglioli Università della Basilicata Unsteady RANS simulations using a 3D unstructured grid solver with Newton-Krylov acceleration Fluid Dynamics 70,000
Elena Borghi Universita’ di Roma “La Sapienza”, Dipartimento di Chimica Binuclear (type 3) copper centres of metalloproteins and model compounds Chemistry 10,000
Elena Borghi Universita’ di Roma “La Sapienza”, Dipartimento di Chimica Structural characterization of adducts of Pt-drugs with macromolecules involved in platinum cellular transport Chemistry 7,000
Gabriella Bretti Università Campus Bio-medico di Roma Localizzazione di densità di corrente nel cervello attraverso algoritmi iterativi sparsi Image Processing 10,000
Paul Bristowe Cambridge University Molecular dynamics of colossal ionic conductivity in epitaxial superlattices Energy Science and Technology 62,000
Sergio Brutti Dipartimento di Chimica Università di Roma La Sapienza DFT modelling of metallic nanoparticles for lithium intercalation Chemistry 15,000
Rocco Caliandro CNR, Istituto di Cristallografia Crystal structure solution by iterative modelling Biology 20,000
Anna Rita Campanelli Department of Chemistry, University of Rome “La Sapienza” Accurate determination of molecular structures and solvation effects using Quantum Mechanics calculations, Molecular Dynamics simulations and X-ray related techniques Chemistry 80,000
Michela Candotti SISSA/ISAS Modulation of alpha-synuclein aggregation by dopamine analogs Bioinformatics 80,000
Massimo Capone INFM-CNR – SMC center Non Equilibrium Dynamics in Strongly Correlated Systems Condensed Matter Physics 40,000
Pierluigi Caramella Deparment of Organic Chemistry Theoretical Studies of Pericyclic Reactions Chemistry 10,000
Marilena Carbone Università Tor Vergata Nanoparticelle di Si in SiO2: relazione tra struttura e proprietà ottiche NanoScience 80,000
Giorgio Cassiani Università di Padova Modellistica alla scala del poro di processi elettro-chimici ed elettro-cinetici in mezzi porosi saturi ed insaturi. Other 8,000
Gastone Castellani Dipartimento di Fisica Università di Bologna Simulazione su larga scala di sistemi neuronali Biology 30,000
Matteo Ceccarelli Dipartimento di Fisica, Universita di Cagliari e SLACS INFM/CNR Uptake of β-lactamase inhibitors through non-specific Bacterial Porins Condensed Matter Physics 80,000
Ester Chiessi Universita di Roma Tor Vergata Studio di Dinamica Molecolare di Idrogel Polimerici Termosensibili Chemistry 15,000
Mauro Chinappi Dipartimento di Meccanica e Aeronautica Università di Roma La Sapienza Simulazione atomistica dello scorrimento di acqua su una parete idrofoba Fluid Dynamics 80,000
Andrea Ciccioli University of Rome La Sapienza – Department of Chemistry Studio di nuove molecole intermetalliche contenenti atomi pesanti Chemistry 10,000
Claudio Conti CNR-INFM Ab-initio simulation of spatio-temporal chaos in nano-structured laser cavities Electromagnetism 80,000
Alessandra Continenza Universita’ degli studi dell’Aquila Magnetic materials for device applications Condensed Matter Physics 20,000
Emiliano Costa Dottorando dell’Università degli Studi di Roma “Tor Vergata”/ D’Appolonia spa SMART-FOAM Fluid Dynamics 60,000
Caterina Cristallini CNR-IMCB Institute of Composite and Biomedical Materials Development of a set of computational models for quantitative evaluation of the mechanical stress state in endovascular stenting Structural Mechanics 80,000
Anna Curir Astronomical Observatory of Torino – Italy The structure of the halos around the galactic disk Astrophysics 30,000
Paola D’Angelo Dipartimento di Chimica, Universita La Sapienza A combined X-ray absorption spectroscopy, Molecular Dynamics simulations and Quantum Mechanics calculation procedure for the structural characterization of ill-defined systems Chemistry 80,000
Ana Damjanovic Johns Hopkins University Dynamics of water molecules in the active site of staphylococcal nuclease Biology 57,600
Maria Laura De Bellis Università “La Sapienza” di Roma Omogeneizzazione computazionale per lo studio delle murature Structural Mechanics 50,000
Giorgio De Luca Istituto per la Tecnologia delle Membrane CNR Studio quantistico delle interazioni tra composti con attività antiossidante-antimicrobica e polimeri biocompatibili (Bio-Based food Materials). Chemistry 80,000
Maria Cristina De Rosa Istituto di Chimica del Riconoscimento Molecolare – CNR Molecular dynamics investigation of the interaction between anticancer anthracyclines and NADPH-dependent cytosolic reductases Chemistry 40,000
Alessandra Degli Esposti Istituto per la Sintesi Organica e la Fotoreattivita` (ISOF) – DPM – CNR Modulazione delle proprieta` ottiche di complessi del Cu(I) mediante sostituzione Chemistry 10,000
Elena Degoli Università di Modena e Reggio Emilia Optical properties of Silicon Nanocrystallites in SiO2 Matrices: Oxidation and Strain Effects NanoScience 80,000
Stefano Della Longa university of l’ aquila Quantitative analysis of XANES spectra of neuroglobin single crystals and solution Biology 50,000
Antonio Di Carlo Università Roma Tre Multiscale mathematical modelling in materials physics: from molecular dynamics to muscle models Mathematics 20,000
Alfredo Di Nola Universita’ di Roma La Sapienza – Dip. Chimica Folding, misfolding ed aggregazione di peptidi e proteine Chemistry 50,000
Valeria Di Sarli Istituto di Ricerche sulla Combustione, Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR) Large Eddy Simulation of Large-Scale Gas Explosions Energy Science and Technology 80,000
Mattia Falconi Università di Roma “Tor Vergata”, Dipartimento di Biologia Studio dell’interazione topoisomerasi I-droghe antitumorali attraverso dinamica molecolare classica e calcoli ab-initio. Biology 75,000
Salvatore Filippone Università di Roma Tor Vergata PSBLAS-MCORE Mathematics 30,000
Vincenzo Fiorentini Universita’ di Cagliari Multiferroicity in rare-earth manganites Condensed Matter Physics 60,000
Francesca Funiciello Dip. Scienze Geologiche Univ. “Roma TRE” Fate of the slab at the 660 km discontinuity and implications for geometry/kinematics/dynamics of the subduction process. Insights from 3-D numerical models. Other 80,000
Stefano Giordano Sardinian Laboratory for Computational Materials Science SLACS (INFM-CNR) Large­scale atomistic simulations of the mechanical properties in nano­materials NanoScience 80,000
Lorenzo Gontrani Univerità di Roma “La Sapienza” Structure and dynamics in Room Temperature Ionic Liquids Chemistry 80,000
Leonardo Guidoni Università dell’Aquila Proprietà dell’acqua in prossimità di molecole idrofobiche. Condensed Matter Physics 78,000
Umberto Iemma University Roma Tre Validation and performance assessment in a large distributed environment of “AcouSTO”, a new open-source boundary element solver for the acoustics Acoustics 60,000
Andrea Ienco ICCOM-CNR Calculation on the Reactivity of the Molecular Hydrogen on Metallic Centers Chemistry 80,000
Ilaria Iermano Stazione Zoologica A.Dohrn Coupled physical-biogeochemical modeling of the Southern Tyrrhenian marine environment Oceanography 30,000
Maurizio Iori Departement of Physics Simulation of 0.1-10 EeV tau decay showers for neutrino astronomy High Energy Physics 80,000
Michele Iovieno Politecnico di Torino, Dipartimento di Ingegneria Aeronautica e Spaziale Mixing and entrainment in turbulent free flows Fluid Dynamics 80,000
Simona Irrera Uiversità di Roma La Sapienza Modelling of DNA/RNA bases Chemistry 20,000
Daniele Iudicone Stazione Zoologica A. Dohrn Phytoplankton biophysical coupling and life strategies and their role in the marine biodiversity Oceanography 40,000
Massimo La Scala Politecnico di Bari HIGH PERFORMANCE COMPUTING FOR FIRE SIMULATIONS and GAS AND TOXIC SUBSTANCES DIFFUSION IN UNDERGROUND TRASPORTATION SYSTEMS Energy Science and Technology 30,000
Alessandro Laio SISSA Optimizing the performance of bias-exchange metadynamics for protein folding Condensed Matter Physics 80,000
Antonio Lavecchia Dipartimento di Chimica Farmaceutica e Tossicologica, Università di Napoli “Federico II” Studio teorico degli effetti dinamici, elettronici e di solvente sulla struttura e l’affinità di legame di complessi tra DNA e composti intercalanti dotati di potente attività antiproliferativa Chemistry 80,000
Valeria Losasso SISSA/ISAS, Scuola Internazionale Superiore di Studi Avanzati Full structure reconstruction of Enterotoxigenic Escherichia coli pseudopilus Biology 80,000
Kevin Maki University of Michigan CALM-WATER RESISTANCE PREDICTION OF A SURFACE-EFFECT SHIP Fluid Dynamics 30,000
Anna Marabotti Institute of Food Science, CNR Study of conformational flexibility of several antimicrobial peptides in solvent and lipid membranes. Bioinformatics 50,000
Marco Masia dipartimento di chimica, universita’ di sassari Computer Simulation of ZIFs as Storage Materials Chemistry 80,000
Paolo Massobrio University of Genova Inferring the functional connectivity of large-scale neuronal networks: from simulated to real networks Biology 75,000
Giuseppe Mattioli Università di Roma “la Sapienza” – ISM-CNR Studio degli effetti di droganti e co-droganti sulla attività fotocatalitica del TiO2 nella regione dello spettro visibile della luce Condensed Matter Physics 80,000
Alessandro Mattoni SLACS, INFM-CNR Atomic-scale modeling of novel nanostructures for advanced photovoltaics NanoScience 80,000
Andrea Mignone Dipartimento di Fisica Generale, University of Torino Numerical Simulations of Radiative Shocks in Herbig Haro Objects Astrophysics 78,000
Blasco Morozzo Della Rocca Dept. Biology, University of Rome “Tor Vergata” Investigation of the ADP/ATP mitochondrial carrier transport through molecular docking and molecular dynamics simulations. Biology 80,000
Vincenzo Mulone Università di Roma Tor Vergata Simulazione fluidodinamica di un combustore a letto fluido Energy Science and Technology 20,000
Giuseppe Murante INAF- Osservatorio Astronomico di Torino Simulating Galaxy Formation with a new, advanced star formation model Astrophysics 80,000
Enrico Nardelli Dipartimento di Matematica, Universita’ di Roma Tor Vergata Analisi sperimentale di grafi ad alta integrazione causale Mathematics 80,000
Paolo Natoli Universita’ di Roma Tor Vergata Data Analysis for Cosmic Microwave Background experiments Astrophysics 50,000
Thierry Nieus IIT Italian Institute of Technology Computation at the input stage of the Cerebellum Biology 80,000
Paolo Orlandi dipartimento di meccanica e aeronautica Transizione in Canali con Rugosita’ Fluid Dynamics 80,000
Stefano Ossicini Università Degli Studi di Modena e Reggio Emilia Ab-initio study of native and dye-sensitized TiO2 nanostructures Condensed Matter Physics 80,000
Paola Paci IAC-CNR Large Scale Simulations of anti-HIV response and therapy Bioinformatics 30,000
Alessandro Paiardini Università La Sapienza Virtual Screening Approaches for the Identification of New Chemotherapeutic Drugs Bioinformatics 50,000
Francesco Paparella Università di Lecce 3D High-Resolution Simulations of Fingering Convection Fluid Dynamics 80,000
Massimo Pappalardo University Roma Tre 3-D Real Time Ultrasound Imaging Acoustics 80,000
Lorraine Pariset università della tuscia Applicazione della Genomic Selection (GS) al miglioramento genetico per la scoperta di geni implicati nella variazione fenotipica Biology 50,000
Nicolae Viorel Pavel Dipartimento di Chimica, Univ. La Sapienza Studio strutturale della denaturazione e della stabilizzazione di proteine. Chemistry 80,000
Massimo Pica Ciamarra CNISM – Consorzio Nazionale Interuniversitario per le Scienze fisiche della Materia The failure transition in granular systems Statistical Mechanics 80,000
Ester Piegari Dipartimento di Scienze della Terra, Universià di Napoli Federico II Study of the statistical properties of cellular automata for the analysis of landslide and volcanic eruption events Statistical Mechanics 80,000
Roberta Pierattelli Universita’ degli Studi di Firenze Determinazione del ruolo e della potenzialità delle metodologie QM e QM/MM nella determinazione dell’energia libera di legame di ligandi attivi su target macromolecolari di interesse farmaceutico Chemistry 80,000
Ugo Piomelli Queen’s University Numerical simulation of relaminarizing flows Fluid Dynamics 40,000
Sergio Pirozzoli Università di Roma ‘La Sapienza’ Detached Eddy Simulation of Compressible Base Flows Fluid Dynamics 80,000
Sergio Pirozzoli Università di Roma ‘La Sapienza’ Direct Numerical Simulation of Boundary Layers at High Mach Numbers Fluid Dynamics 80,000
Marco Pizzarelli Department of Mechanics and Aeronautics, University of Rome, “Sapienza” Simulazione numerica di flussi di base mediante approccio DES e di flussi di fluidi criogenici mediante approccio RANS Fluid Dynamics 80,000
Evgeny Plekhanov Dipartimento di Fisica ’’E. R. Caianiello", Università di Salerno Two-orbital Hubbard model as a prototype for doped Phthalocyanine conductors Condensed Matter Physics 80,000
Fabio Polticelli Department of Biology, University Roma Tre Molecular dynamics simulations of algal photoreaction center mutants for biotechnological applications Bioinformatics 60,000
Alessandro Ponti ISTM-CNR Rate constants for the nucleation and growth of gold nanoclusters and nanoparticles NanoScience 80,000
Paolo Postorino Universita’ di Roma “Sapienza” Studio della transizione isolante metallo indotta dalla pressione in sistemi semplici: il Te cristallino e lo I2 liquido. Condensed Matter Physics 55,000
Roberto Purini National Research Council – ISAC On the natural variability of the North Atlantic Thermohaline Circulation and its possible modification by anthropogenic effects Climatology 80,000
Nadia Rega Dipartimento di Chimica “Paolo Corradini” e CR-INSTM “Village”, Università di Napoli Federico II Approccio computazionale integrato per lo studio dei processi chimico-fisici in sistemi modello di interesse per la biosensoristica Chemistry 80,000
Franco Rispoli Dipartimento di Meccanica e Aeronautica ‘Sapienza’ Uniersità di Roma Internal and External Cooling Analysis in Gas Turbine Blades Fluid Dynamics 80,000
Michele Rizzi Dipartimento di Fisica Teorica – Università di Trieste Interazione dell’anidride carbonica con cluster di nickel depositati su MgO/Ag(100) Condensed Matter Physics 40,000
Aldo Rona University of Leicester Unsteady flow and noise from airframe cavities Fluid Dynamics 80,000
Marcello Rosini Università di Modena e Reggio Emilia Quantum Dot nucleation on stepped semiconductor surfaces Condensed Matter Physics 80,000
Paola Rossi INAF Ossservatorio Astronomico di Torino Instabilities in astrophysical accretion discs Astrophysics 75,000
Mauro Rovere Dipartimento di Fisica, Universita’ Roma Tre Comparative study of aqueous solutions of disaccharides upon supercooling by Molecur Dynamics simulation Condensed Matter Physics 80,000
Paolo Ruggerone CNR-INFM-SLACS and Department of Physics, University of Cagliari Computational study of the microscopic mechanism of oxygen binding/unbinding in Hemoglobin Condensed Matter Physics 80,000
Maria Vittoria Salvetti University of Pisa Simulation of cavitating flows in turbopump inducers Fluid Dynamics 40,000
Fabrizio Santoro IPCF-CNR Studio computazionale degli spettri di assorbimento ed emissione dei cromofori clorofilla nel complesso antenna LCHII Chemistry 25,000
Angelo Schiavi Università di Roma “La Sapienza” Three-dimensional hydrodynamic plasma simulations for fusion energy development. Plasma Physics 20,000
Antonio Scialdone Università di Napoli Federico II, Dip. di Scienze Fisiche – INFN Napoli The Statistical Mechanics of X Chromosome Inactivation Statistical Mechanics 80,000
Zecchetto Stefano Istituto Scienze dell’Atmosfera e del Clima, Consiglio Nazionale delle Ricerche High resolution numerical simulations of the wind fields over the Venice Lagoon Meteorology 50,000
Fabio Sterpone Ecole Normale Superieure Map of water lability around globular proteins Statistical Mechanics 75,000
Federico Toschi IAC-CNR Modellizzazione sotto-griglia e statistiche Lagrangiane in turbolenza. Fluid Dynamics 80,000
Roberto Verzicco Dipartimento di Ingegneria Meccanica, Università di Roma `Tor Vergata’ Simulazione numerica diretta del flusso in una valvola cardiaca meccanica Fluid Dynamics 50,000
Rosa Maria Vitale Istituto di Chimica Biomolecolare (ICB) -Consiglio Nazionale delle Rircerche (CNR) Water transport properties of Aquaporin-5 and its phosphorylated forms by equilibrium and non-equilibrium Molecular Dynamics simulations Chemistry 60,000
Stefano Zaghi La Sapienza, Università di Roma Solid Rocket Motor Numerical Simulation Fluid Dynamics 30,000
Francesco Zonta Università degli Studi di Padova. Dipartimento di Fisica Galileo Galilei Studio delle mutazioni M34T e V95M in emicanali di connessina 26 Bioinformatics 30,000